Изображение области связывания ДНК с RUVA_ECOLI

На рисунке представлена часть зоны связывания ДНК с белком RUVA_ECOLI.

Если Вы хотите увидеть все остальные иллюстрации...

Проект генно-инженерного эксперимента

С ДНК непосредственно взаимодействуют gly115, gly117, lys119, gly80, gly82, lys84. При этом в остатках глицинов с ДНК образуют водородные связи группы -NH- полипептидной цепи, и эти связи менее прочные, чем образуемые лизинами lys119 и lys84.

Лизин имеет в качестве активной группы аминогруппу, за счет которой и образуется водородная связь. Если заменить один из лизинов на неполярную или содержащую карбоксильную группу аминокислоту, то в этом месте связывания не будет. Если заменить оба лизина на крупные неполярные радикалы (например, на фенилаланин), то это может привести к разрушению комплекса, т.к. разрушатся и водородные связи глицинов с ДНК.

Можно предположить несколько замен в полипептидной цепочке, которые скорее всего не повлияют на связывание белка с ДНК. Во-первых, если заменить лизин на сходный по размерам радикала аргинин, то, скорее всего, связь сохраниться. Если же заменить один из глицинов на другую аминокислоту с небольшим по размеру радикалом, то это не помешает взаимодействию ДНК и белка.

Возврат на страницу первого семестра